·胸部疾病·
呼吸道感染样本中IFITMs引物优化
作者:左清利1,2 鲁艳芹1,2 韩金祥1,2
所属单位:1.济南大学-山东省医学科学院医学与生命科学学院(山东 济南 250200)2.山东省罕少见病重点实验室,山东省医药生物技术研究中心,山东省医学科学院(山东 济南 250062)
PDF摘要
目的 优化干扰素诱导的跨膜蛋白(Interferon induced transmenmbrane proteins,IFITMs)的五个亚型基因,即 IFITM1、IFITM2、IFITM3、IFITM5和IFITM10。方法 提取呼吸道感染样本中核酸,通过RT-qPCR筛选出具有特异性 的引物且Ct值在[15,35]之间,再利用琼脂糖凝胶电泳对引物的特异性进行近一步的验证。结果 RT-qPCR结果显示 IFITM1相关引物中IFITM1-3具有特异性;IFITM2相关引物中IFITM 2-2具有特异性;IFITM3相关引物IFITM3-2有较 好特异性;IFITM5相关引物中IFITM5-4具有特异性;IFITM10相关引物中IFITM10-1、IFITM10-2、IFITM10-3具有特 异性。具有特异性的所有引物的琼脂糖凝胶电泳条带单一明亮。结论 IFITM1-3优于该基因的其它引物;IFITM2-2 优于IFITM2-1;IFITM3-2优于IFITM3-1;IFITM10-1、 IFITM10-2 和IFITM10-3均适用。
Objective To optimize the five subtypes of interferon inducible transmembrane proteins, namely IFITM1, IFITM2, IFITM3, IFITM5 and IFITM10. Methods Extraction of nucleic acids from respiratory tract infection samples. Specific primers were screened by qRT-PCR and Ct value was between (15,35), and the specificity of primers was verified by agarose gel electrophoresis. Results IFITM1-3 was specific in the IFITM1 primers. IFITM 2-2 was specific in the IFITM2 primers. IFITM3-2 was specific in the IFITM3 primers. IFITM5-6 was specific in the IFITM5 primers. IFITM10-1, IFITM10-2 and IFITM10-3 were specific in the IFITM10 primers. Agarose gel electrophoresis bands of all primers with specificity were single bright. Conclusion IFITM1-3 was superior to other primers of IFITM1 primers. IFITM 2-2 was superior to other primers of IFITM2 primers. IFITM3-2 was superior to other primers of IFITM3 primers. IFITM5-4 was superior to other primers of IFITM5 primers. IFITM10-1, IFITM10-2 and IFITM10-3 were superior to other primers of IFITM10 primers.
【关键词】呼吸道感染;引物;IFITMs
【中图分类号】R373.1
【文献标识码】A
【DOI】10.3969/j.issn.1009-3257.2017.02.009
前言
全球近二百万的儿童死亡病例是由于急性呼吸道 感染(ARI)导致的[1]。病毒是呼吸道感染的主要病原 体,如呼吸道合胞病毒、腺病毒和偏肺病毒等[2]。小 儿支原体肺炎也是儿科常见疾病,利用阿奇霉素序贯 疗法进行治疗能迅速缓解患儿临床症状[3]。干扰素诱 导跨膜蛋白(interferon inducible transmembrane proteins,IFITM)[4]在人类中包括5个基因,分别是 IFITM1、IFITM2、IFITM3、IFITM5和IFITM10,位于 11号染色体上。IFITM1、IFITM2和IFITM3的抗病毒效 应一直是研究的热点,但IFITM5和IFITM10在呼吸道 病毒感染中的研究尚未报道。
罕少疾病杂志
第24卷, 第 2 期
2019年11月
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