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论著·综合·

Hsa_circ_0008957靶MiRNA预测及其表达载体构建

作者:李仙仙1 鲁艳芹1,2,* 韩金祥1,2,*

所属单位:1.山东第一医科大学(山东省医学科学院)生物医学科学学院 (山东 济南 250014) 2.山东第一医科大学第一附属医院内分泌科 (山东 济南 250062)

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摘要

目的 构建Ⅰ型胶原蛋白结构基因COL1A2的靶向circRNA hsa_circ_0008957其靶向miRNA的功能。方法 采用circbase软件,获取hsa_circ_0008957序列,采用PCR进行circRNA克隆,通过同源重组接入circRNA表达载体pCD2.1。重组载体pCD2.1-hCOL1A2_circ_0008957通过PCR、双酶切、Sanger测序进行验证。利用circBANK,circinteractome网站进行hsa_circ_0008957靶miRNA及其功能预测。结果 pCD2.1-hCOL1A2-circ-0008957重组载体构建成功。Hsa_circ_0008957预测出该circRNA不具有蛋白编码功能,其靶miRNA hsa_miR_1305,hsa_miR_140-3p,hsa_miR_421,hsa_miR_548c_3p和hsa_miR_628-3p与成骨相关,预测hsa_circ_0008957可能通过这些miRNA参与成骨分化。结论Hsa_circ_0008957通过miR-1305、miR-140-3p、miR_421、miR_548c_3p和miR_628_3p参与成骨分化,且预测COL1A2靶向miRNA与17种miRNA取交集,得出hsa_miR_618,该miRNA与肿瘤疾病相关,为后续在细胞水平上进一步验证hsa_circ_0008957的调节功能奠定了基础。


【关键词】COL1A2;hsa_circ_0008957;快速克隆;生物信息学预测

【中图分类号】R34

【文献标识码】A

【DOI】10.3969/j.issn.1009-3257.2022.01.033