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指南与共识

滤纸干血斑用于脊髓性肌萎缩症基因筛查方法的建立*

作者:吴莉萍1 高玲亮1 杨江涛1,2 付有晴3 刘彦慧3 顾茂胜4 何红琴5 杨艳玲6,*

所属单位:1.深圳爱湾医学检验实验室 (广东 深圳 518000) 2.深圳罕见病代谢组学精准医学工程研究中心 (广东 深圳 518000) 3.东莞市妇幼保健院产前诊断中心 (广东 东莞 523000) 4.徐州市妇幼保健院遗传医学中心 (江苏 徐州 221000) 5.运城市妇幼保健院遗传科 (山西 运城 044000) 6.北京大学第一医院儿科 (北京 100034)

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摘要

目的 建立滤纸干血斑基因组DNA自动化提取方法及流程,并探索其在脊髓性肌萎缩症(SMA)基因筛查中的应用。方法 收集45份干血斑标本,采用打孔钳打孔后提取DNA,使用多重PCR结合荧光探针技术进行SMN1检测,考察最低起始干血斑用量。收集103份4℃不同保存时长的新生儿干血斑和17份EDTA 抗凝血制备的干血斑,使用最低起始量提取DNA并检测SMN1,考察运输与保存条件对基因检测结果稳定性的影响。结果 最低1片直径4mm的干血斑所提 取的DNA浓度2.54~5.71ng/μL、纯度1.676~1.984,可满足SMN1检测要求。4℃避光保存1~24个月的新生儿干血斑标本,新鲜采集并经冷链运输48~72h 的EDTA抗凝血及-80℃超低温冷冻保存1~2年的EDTA抗凝血制备的干血斑标本均可稳定检出SMA基因型。结论 1片直径4mm的干血斑即可满足SMN1检测要求,大大降低了样本采集、保存和运输的难度和复杂程度,有利于开展大规模人群筛查,为现有新生儿筛查体系下增加SMA筛查提供了技术基础。

【关键词】滤纸干血斑;脊髓性肌萎缩症;DNA提取;SMN1;新生儿筛查;最低起始量

【中图分类号】R744

【文献标识码】A

【DOI】10.3969/j.issn.1009-3257.2022.09.001